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Por Redação SciAdvances
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Combinando farmacologia, biologia estrutural e bioquímica, o processo de descoberta de novos fármacos e desenvolvimento de medicamentos para doenças específicas é um processo caro e que pode consumir mais de uma década.
Uma parte importante desse processo é a identificação de moléculas que sejam boas candidatas a fármacos, com características e propriedades específicas.
A partir de uma boa base de conhecimento formada por dados moleculares resultantes de anos de pesquisa, a inteligência artificial (IA) pode ser uma ferramenta essencial para acelerar esse processo e indicar novas potenciais moléculas.
Mas a geração de moléculas inovadoras, que não sejam apenas semelhantes às estruturas dos dados de treinamento, ainda é um desafio para a maioria dos modelos de IA.
Avanço: plataforma usa novo modelo de IA e dados abertos para acelerar descobertas
Pesquisadores do consórcio OpenBind publicaram um novo conjunto de dados que pode ser usado pelo modelo preditivo de IA para acelerar o processo de descoberta de fármacos.
O consórcio OpenBind foi cofundado pela Universidade de Oxford e pela Diamond Light Source, no Reino Unido, como o primeiro programa dedicado à produção de conjuntos de dados específicos para a descoberta de fármacos em escala industrial, projetados especificamente para IA e disponibilizados de forma contínua e aberta.
Os dados experimentais da plataforma OpenBind, gerados usando pipelines de alto rendimento na Diamond Light Source, combinam química automatizada e medições robustas de ligações e cristalografia com dados processados em formatos adequados para aprendizado de máquina.
Atualmente, estão disponíveis 699 compostos ligados à proteína do vírus EV-A71, com medições da força de ligação para 601 compostos – um dos maiores conjuntos de dados públicos para um único alvo proteico.
Novos avanços incluem otimização do modelo de IA e expansão da base de dados
Para avançar com o projeto OpenBind, os pesquisadores estão gerando grandes volumes de novos dados experimentais, com o objetivo de alimentar os modelos de IA com dados que permitam ir além do reconhecimento de padrões em dados existentes e começar a fazer previsões mais confiáveis sobre novos fármacos.
O conjunto de dados e o modelo de IA específico para o alvo da protease EV-A71 2A estão disponíveis gratuitamente para pesquisadores do mundo todo como base para o desenvolvimento e teste de novas abordagens computacionais.
Novas liberações de dados estão planejadas à medida que o programa se expande para incluir mais alvos e conjuntos de dados maiores. Um novo modelo preditivo geral, o OpenBind-v1, também deverá ser lançado em breve.
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Acesse documentos, ferramentas e dados na plataforma OpenBind (em inglês).
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