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Nova técnica mapeia centenas de proteínas simultaneamente dentro de núcleos celulares
2 de janeiro de 2025, 14:12

Fonte

Lori Dajose, Caltech

Publicação Original

Instituto de Tecnologia da Califórnia

Áreas

Bioinformática, Biologia, Engenharia Biológica, Genética, Genômica, Microbiologia

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Resumo

Pesquisadores liderados pelo Dr. Mitchell Guttman, professor de Biologia do Instituto de Tecnologia da Califórnia (Caltech), nos EUA, desenvolveram um novo método para mapear, simultaneamente, as posições de centenas de proteínas associadas ao DNA dentro de núcleos celulares e tirar instantâneos de como elas mudam ao longo do tempo.

A Dra. Carolina Salomao Lopes, doutora pela Universidade Federal do Triângulo Mineiro (UFTM) e atualmente pesquisadora sênior de Bioinformática e Biologia Integrativa da Escola Médica UMass Chan, nos EUA, também é coautora do trabalho.

O método, chamado ChIP–DIP (Chromatin ImmunoPrecipitation Done In Parallel), é uma ferramenta versátil para compreender o funcionamento interno do núcleo celular durante diferentes contextos, como em doenças ou durante o desenvolvimento.

A nova tecnologia é extremamente poderosa para entender a regulação genética durante diferentes fases de doenças, disseram os pesquisadores. Enquanto as técnicas anteriores só conseguiam mapear um único tipo de proteína por vez, o método ChIP–DIP pode analisar centenas de proteínas de uma vez para dar uma imagem abrangente em tipos de células raras e em amostras de tecidos saudáveis ​​e doentes de pacientes.

“Usamos o ChIP–DIP para mostrar como, após um evento inflamatório, as células do sistema imunológico alteram rapidamente suas proteínas histonas em um intervalo de horas para ativar genes inflamatórios. Também usamos o ChIP–DIP para identificar combinações de proteínas que regulam quais genes estão ativos ou se tornarão ativos em resposta ao estresse ou durante o desenvolvimento. Projetos internacionais anteriores baseados em consórcios levaram quase uma década para conduzir alguns milhares de experimentos, mas agora fizemos mais de 500 no intervalo de algumas semanas”, disse a Dra. Isabel Goronzy, que concluiu seu doutorado em 2024 no laboratório do professor Mitchell Guttman.

Os resultados da pesquisa foram publicados recentemente na revista científica Nature Genetics.

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Autores/Pesquisadores Citados

Dr. Mitchell Guttman

Professor de Biologia do Instituto de Tecnologia da Califórnia (Caltech)

Dra. Isabel Goronzy

Pesquisadora do Caltech

Dra. Carolina Salomao Lopes

Pesquisadora sênior de Bioinformática e Biologia Integrativa da Escola Médica UMass Chan

Publicação

Acesse o resumo do artigo científico (em inglês).

Acesse a revista científica Nature Genetics (em inglês).

Mais Informações

Acesse a notícia original completa na página do Instituto de Tecnologia da Califórnia (em inglês).

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