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Resumo
Uma parceria entre a Universidade Federal de Lavras (UFLA) e a Universidade Federal do Tocantins (UFT) resultou no desenvolvimento da plataforma RGeasy®, uma ferramenta inovadora e gratuita que facilita a escolha de genes de referência em pesquisas na área da Biologia Molecular e estudos de expressão gênica.
O projeto nasceu a partir da pesquisa de Micaele Rodrigues de Souza, egressa do mestrado em Agroenergia Digital da UFT, e contou com a colaboração do curso de Ciências da Computação da mesma instituição e do Laboratório de Fisiologia Molecular de Plantas (LFMP) da UFLA.
Esses genes de referência funcionam como um ‘padrão de comparação’ e são essenciais para garantir a precisão dos experimentos que investigam como os genes se comportam em diferentes situações.
A novidade é especialmente útil em estudos que utilizam a técnica RT-qPCR (Reação em Cadeia da Polimerase com Transcrição Reversa em Tempo Real). O método permite aos cientistas medir com precisão o nível de atividade de genes, ajudando a entender como os organismos reagem a diferentes condições.
A RGeasy® é a primeira plataforma on-line com um banco de dados baseado em valores de Cq (ciclos de quantificação), que indicam o momento em que o gene começa a ser detectado em uma amostra. Quanto mais cedo isso acontece, mais abundante esse gene está na amostra.
Com a ferramenta, pesquisadores podem identificar rapidamente os genes de referência mais adequados para diferentes condições experimentais. Antes da ferramenta, era necessário realizar estudos específicos para validar esses genes, um processo que demandava tempo e recursos. Agora, com poucos cliques, os usuários têm acesso a um ranking dos genes mais estáveis, além de conjuntos de primers (pequenos fragmentos de DNA utilizados para amplificar sequências genéticas).
Inicialmente desenvolvido com dados das espécies de café Coffea arabica e Coffea canephora, a RGeasy® é uma plataforma versátil, podendo ser aplicada a diversas espécies, incluindo plantas, animais e microrganismos.
“Na área da saúde, [a plataforma] poderá contribuir para pesquisas sobre doenças genéticas, oncogenes e genes supressores tumorais, doenças autoimunes e medicina de precisão, ampliando as possibilidades de análises em diferentes contextos científicos”, destacou o Dr. Horllys Gomes Barreto, professor e coordenador do Laboratório de Análises Moleculares da UFLA.
A plataforma, que rendeu uma publicação na revista científica BMC Genomics no final de 2024, está disponível on-line, em português e inglês, facilitando o acesso para pesquisadores de todo o mundo. De forma intuitiva, permite que os valores de Cq de experimentos sobre genes de referência já realizados sejam facilmente depositados em sua base de dados.
Em suas publicações, o Portal SciAdvances tem o único objetivo de divulgação científica, tecnológica ou de informações comerciais para disseminar conhecimento. Nenhuma publicação do Portal SciAdvances tem o objetivo de aconselhamento, diagnóstico, tratamento médico ou de substituição de qualquer profissional da área da saúde. Consulte sempre um profissional de saúde qualificado para a devida orientação, medicação ou tratamento, que seja compatível com suas necessidades específicas.
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Acesse o artigo científico completo (em inglês).
Acesse a revista científica BMC Genomics (em inglês).
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Acesse a plataforma RGeasy®.
Acesse a notícia original completa no Portal da Ciência da Universidade Federal de Lavras.
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